试管婴儿多为体外受精，体外受精胚胎中X染色体容易失活，这可能是导致性别失衡的主要原因。X染色体失活是女性胚胎在早期发育过程中经历的表观遗传修饰事件，如果这种机制被削弱，将导致女性胚胎发育异常，从而导致性别失衡，出现男孩子多的现象。

无论是第一代试管婴儿或是第二代试管婴儿，都无法在试管过程中选择胎儿性别，所以其男女比例一样，不存在男孩多的说法。而第三代试管婴儿虽然可以对胎儿性别进行选择，但是一般非医学需要，国家禁止做第三代试管婴儿。