目前国内的公立医院做第三代试管婴儿费用基本是8万起一个治疗周期的了，而多一个治疗周期的费用要增加2万元左右。第三代试管费用要预算10万以上，有这个心理准备。试管婴儿有好几个治疗周期，而每一个周期的费用是不一样的，同时治疗前还有检查的费用。一般来说具体的费用的金额各个地方都是不一样的。因而在做试管婴儿前要问好费用的具体情况，根据自身的经济条件进行选择。
有些卵巢功能减退或高龄女性，可能需要2-3个促排卵周期，才能进行胚胎筛查。而且三代试管受精的方式，是采用单精子卵泡浆内注射，所以耗费也比一代试管费用大。另外还需要冷冻胚胎及胚胎复苏，这些都增加了三代试管的费用。
1、促排卵药物的费用：因使用的药物不同，分进口药和国产药 ，费用差别也就很大，大致范围在3-5万不等 ，这部分的费用和第一代第二代促排卵阶段的费用是一样的。因为每个人的卵巢情况不同，促排计划也会会有所不同，比如年轻一点的女性卵泡多 ， 发育好，用药就少 ，妨的年龄越大，药量越大，费用也就越高。
2、实验室操作费用：第三代试管婴儿技术的核心是胚胎遗传物质的筛查和诊断(PGD/PGS) ，所以实验室操作费用比较高，因为这-步对设备的要求和操作人员的技术要求很高，其费用与筛查胚胎的数量、应用的技术有关。再加上胚胎冷冻的费用 ，胚胎冷冻的数量越多，费用就越高，一般情况下， 实验室操作的费用就要达到5-6万元。
3、各种检查和手术费用：做第三代试管婴儿前后 ，夫妻双方都要做检查。费用差不多1万左右，在做试管婴儿期间，也要经常通过检查，来检测治疗的方案的，以便于医生调整药量，达到更好的治疗效果。
4、试管婴儿进行胚胎冷冻费用：关于胚胎冷冻的管理费用是根据每个不同地区的医院的及医院的技术等因素的影响，价格也不同，一般会以月或者年为计算单位，像一些普通的医院，在收取胚胎冷冻费用的时候，是从600元到1000元不等，而医疗技术好、高-级别的医院在收取胚胎冷冻费用的时候，一年的费用大概是 3000元起步的样子。做胚胎冷冻最好选择正规的有成熟冷冻技术的大医院比较好。胚胎移植后 ，剩余可以保存在试管婴儿医院，以便今后使用。一般情况下，胚胎能够冷冻保存5-10年。
1、染色体异常
染色体异常可分为数目异常和结构异常。其中结构异常有相互平衡易位、罗氏易位、倒位等，携带这类染色体结构异常者常常表型正常，只是在生育年龄出现不孕不育、反复自然流产、生育畸形智障儿后，行染色体检查才被发现。这类染色体结构异常携带者所产生的生殖细胞可能出现染色体不平衡畸变，从而导致不良妊娠结局。其产生正常生殖细胞的概率因人而异，和结构异常的类型、所涉及的染色体以及断裂点的位置有关。PGD可以选择染色体平衡的胚胎进行移植，避免反复自然流产的发生。
2、单基因疾病
单基因疾病是指由一对等位基因突变即可导致的疾病，如先天性耳聋、脊肌萎缩症、地中海贫血、脊髓小脑共济失调等。人类已知的单基因疾病达6000～7000种，其中已明确致病基因的有约4000种。有家族史的生育高风险夫妇，可以通过试管婴儿程序，对胚胎突变基因位点的直接序列分析和多态位点的连锁分析可以准确的判断胚胎是否致病，近年来，二代测序技术在这一领域的应用大大增加了单基因病PGD的准确率和检测效率。
3、遗传易感基因的剔除
某些多基因病具有高度的遗传度，即某个基因突变导致患病风险明显增加。最典型的例子就是BRCA1/BRCA2基因突变携带者发生乳腺癌和卵巢癌的风险大大增加，而且致病基因会以50%的风险遗传给后代。PGD也可以用于阻断家族中遗传易感基因的传递。
4、HLA配型选择
对于一些恶性血液系统疾病，骨髓移植常常是最有效的治愈手段，但是无法寻得HLA配型相同供体常常让这类患者失去了生的机会。HLA配型选择即是通过试管婴儿技术，选择生育一个HLA配型和第一个患儿相同的宝宝，取其脐带血干细胞或者骨髓干细胞治疗其患病的哥哥或姐姐，这个宝宝也被称为“救世主婴儿”。2000年，世界上首例HLA配型选择婴儿在美国出生，他的脐带血干细胞被收集用于治疗他患病的姐姐。
5、医疗目的性别选择
非医疗目的的性别选择在我国是非法的。但是，对于一些性连锁遗传性疾病，如假肥大型肌营养不良、甲型血友病等一般只在男孩中发病，女孩不发病。虽然这类疾病致病基因明确，可以通过单基因PGD程序预防患儿的出生。但是对于部分家系基因诊断不明，或者技术条件不允许的情况下，可以单纯行性别选择生育女孩，避免疾病的发生。此外，对于男性Y染色体微缺失患者(AZFc缺失)也可以通过性别选择生育女孩，而阻断缺陷基因传递给自己的儿子。
6、胚胎非整倍体筛查
试管婴儿技术过程中的胚胎染色体非整倍体比较常见，并且在高龄女性、反复自然流产、反复种植失败、严重男性不育患者中发生率更高，所以通过检测胚胎染色体非整倍体性，选择整倍体胚胎移植，可以提高试管婴儿的成功率，这也被称为胚胎植入前遗传学筛查(PGS)。PGS选择性单胚胎移植，可以在不影响试管婴儿成功率的基础上，有效降低多胎妊娠风险。
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总的来说国内第三代试管婴儿费用跟美国、泰国、俄罗期的第三代试管费用相比还是很便宜的。第三代比第一二代要贵很多的原因主要是，在进行了一二代的流程之后，在胚胎移植到体内之前会进行细致的遗传学分析和筛查，以确保胚胎是健康的。第三代试管婴儿主要偏向于解决：夫妻中有遗传疾病、白化病、38岁以上高龄以及染色体选择等。
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