临床医学一级学科是广东省优势重点学科，拥有19个省级二级和三级重点学科、临床重点专科和重点实验室，全院省级临床学科重点单元覆盖率100%。其中心血管内科是广东省“十一五”、“十二五”医学重点学科和广东省临床重点专科，妇产科是广东省“十二五”医学重点学科，骨科、神经外科、新生儿科、临床护理、神经内科、内分泌科、急诊科、检验科、儿科、胸外科、肾内科、医学影像科、眼科、血液科、普通外科是广东省临床重点专科，分子心脏病实验室是广东省“十二五”医学重点实验室；生殖医学科是粤东地区首家获准开展体外受精-胚胎移植及其衍生技术的不孕不育诊疗机构。医院同时是广东省儿童白血病、先心病定点救治医院。